Per le Pmi del Mezzogiorno ci sono  nuove opportunità di sviluppo. Si tratta di contributi a fondo perduto e finanziamenti agevolati per avviare programmi di investimento nel settore delle energie rinnovabili e del risparmio energetico.  Sono tre i nuovi specifici decreti destinati alle imprese di Sicilia, Campania, Puglia e Calabria. Inoltre, è in corso di valutazione la richiesta di Basilicata e Sardegna per estendere il regime nei rispettivi territori grazie all'utilizzo delle risorse liberate dalla programmazione 2000-2006. Si tratta di 500 milioni di euro da destinare alle piccole e medie imprese che effettuano investimenti produttivi innovativi, ossia acquistano immobilizzazioni, anche sotto forma di locazione finanziaria: industrializzazione dei risultati di ricerca, utilizzo di tecnologie innovative, energie rinnovabili, efficienza energetica.
Nello dettaglio sono stati stanziati:  100 milioni per piani di investimento finalizzati all'industrializzazione dei programmi qualificati di ricerca e sviluppo sperimentale; 100 milioni per piani di investimento volti al perseguimento di specifici obiettivi di innovazione, miglioramento competitivo e tutela ambientale (attività del settore alimentare, fabbricazione di apparecchiature elettriche, produzione di biotecnologie);  300 milioni per piani di investimento riguardanti la produzione di beni strumentali funzionali allo sviluppo di fonti di energia rinnovabili e al risparmio energetico nell'edilizia.